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Atril supporta i seguenti formati:
Comic Book Archive (.cbr and .cbz)
Device Independent file format (.dvi)
DjVu (.djvu, .djv)
Open XML Paper Specification (.oxps, .xps)
Portable Document Format (.pdf)
PostScript (.ps)
In alcune distribuzioni Linux non tutti i formati potrebbero essere supportati di default, quindi alcuni dei formati mostrati precedentemente potrebbero non essere visualizzabili.
Il supporto per un formato è chiamato backend. Se si ottiene l'errore «Impossibile aprire il documento», dovreste accertarvi che il pacchetto di backend del formato in questione sia installato.